Остается только добавить, что в соответствии с подпунктом «а» пункта 9 ст. 4 Положения о порядке прохождения военной службы
9. Контракт прекращает свое действие:
а) со дня исключения военнослужащего из списков личного состава воинской части при увольнении с военной службы, в связи с гибелью (смертью), признанием безвестно отсутствующим или объявлением умершим;
Таким образом, не смотря на то, что ваши права и процедура увольнения нарушены, вы продолжаете оставаться военнослужащим, проходящим военную службу по контракту, и соответственно на вас распространяются все должностные, общие и специальные обязанности.
По личному опыту службы в войсках, если командир готовит повторно документы к увольнению и не ставит палки в колеса, просто произошла ошибка в оформлении документов, то служите и ни с какими жалобами не обращайтесь. Прокуратура вам в этом деле не поможет, вынесет представление, накажут командира, но процесс от этого не ускорится. А вот отношение к вам испортится, личное дело отправят через полгода после исключения из списков части, «забудут» вшить приказ об увольнении или исключении из списков части, потеряют другие документы, не дадут вам положительную характеристику и будете вы еще долго заключать контракт в другой части. Будете исполнять обязанности, то у вас есть возможность договорится в получении личного дела на руки и ускорить поступление на службу в другом месте. Также можете запросить, чтобы вам выдали выписку из послужного списка, а также заверенные копии документов, находящихся личном деле, чтобы была возможность решать вопрос с поступлением на службу до того, как в военкомат поступит личное дело.
Да , за 3 месяца до окончания срока писал рапорт
Во многих частях требуют письменного заявления о том что контракт продлевать военнослужащий не будет. Это что-то вроде внутреннего регламента.