Елена, добрый вечер!
В соответствии со ст. 177 ТК РФ гарантии и компенсации работникам, совмещающим работу с обучением, в обязательном порядке предоставляются при получении образования соответствующего уровня впервые.
В соответствии с подп. б пункта 2 части третьей ст. 12 ФЗ РФ «Об образовании в РФ» от 29.12.2012 г. образовательные программы высшего образования — программы бакалавриата, программы специалитета, программы магистратуры.
Таким образом, Ваше первое образование по программе специалитета и образование по программе магистратуры, по которому Вы сейчас проходите обучение, являются образованиями одного уровня. И соответственно гарантии и компенсации, предусмотренные главой 26 ТК РФ, на Вас не распространяются.
Гарантии и компенсации также могут предоставляться работникам, уже имеющим профессиональное образование соответствующего уровня и направленным на обучение работодателем в соответствии с трудовым договором или соглашением об обучении, заключенным между работником и работодателем в письменной форме.
Вам стоит обсудить с руководством организации, в которой Вы работаете, возможность заключения с Вами ученического договора в соответствии со ст. 198 ТК РФ, если в Вашей работе Вам необходимо наличие специального образования.
но отдел кадров утверждает что у меня второе высшее образование и эти стать ТК не распростроняются на меня, более того с меня удерживают за оплату ранее выданого ученического отпуска, издали указ что мне не положены отпускные
Необходимо через суд обжаловать действия по удержанию за оплату ранее выданого ученического отпуска и издание приказа что Вам не положены отпускные