Александр, здравствуйте!
Согласно п. 4 Правил подачи иностранным гражданином или лицом без гражданства
уведомления о подтверждении своего проживания в РФ:
Постоянно проживающим в Российской Федерации иностранным гражданином уведомление подается лично или в установленном порядке направляется почтовым отправлением при предъявлении документа, удостоверяющего его личность и признаваемого Российской Федерацией в этом качестве, а также его вида на жительство.
Т.е., согласно постановлению, подача в электронном виде (через портал госуслуг) не представляется возможным.
Однако п. 6 ст. 8 Федерального закона «О правовом положении иностранных граждан» такую возможность предоставляет:
Подача данным иностранным гражданином уведомления осуществляется им лично или в установленном порядке почтовым отправлением при предъявлении документа, удостоверяющего личность данного иностранного гражданина и признаваемого Российской Федерацией в этом качестве, а также его вида на жительство либо путем направления уведомления в форме электронного документа с использованием информационно-телекоммуникационных сетей общего пользования, в том числе сети Интернет, включая единый портал государственных и муниципальных услуг.
Закон имеет высшую юридическую силу, поэтому подать уведомление в электронном виде (через портал госуслуг) Вы можете.