Здравствуйте, Олег Владимирович!
Ваша мама на общих основания, предусмотренных ст.407 НК РФ, освобождена от налога на один жилой объект по ее выбору.
Скорее всего в данном случае просто недоработка налоговых органов.
Рекомендую вам подать сведения в налоговый орган. Такая обязанность предусмотрена Налоговым кодексом.
Статья 23. Обязанности налогоплательщиков (плательщиков сборов)
2.1. Налогоплательщики — физические лица по налогам, уплачиваемым на основании налоговых уведомлений, помимо обязанностей, предусмотренных пунктом 1 настоящей статьи, обязаны сообщать о наличии у них объектов недвижимого имущества и (или) транспортных средств, признаваемых объектами налогообложения по соответствующим налогам, в налоговый орган по своему выбору в случае неполучения налоговых уведомлений и неуплаты налогов в отношении указанных объектов налогообложения за период владения ими.
Указанное сообщение с приложением копий правоустанавливающих (правоудостоверяющих) документов на объекты недвижимого имущества и (или) документов, подтверждающих государственную регистрацию транспортных средств, представляется в налоговый орган в отношении каждого объекта налогообложения однократно в срок до 31 декабря года, следующего за истекшим налоговым периодом.
Сообщение о наличии объекта налогообложения, указанное в абзаце первом настоящего пункта, не представляется в налоговый орган в случаях, если физическое лицо получало налоговое уведомление об уплате налога в отношении этого объекта или если не получало налоговое уведомление в связи с предоставлением ему налоговой льготы.
В приведенной статье сказано, что обращаться можете в налоговый орган по своему выбору. То есть в любой: или по месту жительства или по месту нахождения объекта недвижимости. У них единая база, поэтому в любом случае информация дойдет до нужного места.