Согласно письму Роструда от 08.12.2008 № 2742-6-1 по общему правилу действующее трудовое законодательство, допуская заключение в установленных законом случаях срочного трудового договора, не предусматривает возможности и порядка его переоформления и продления. При заключении срочного трудового договора правовых оснований для продления срочного трудового договора на новый срок без расторжения прежнего договора (с оформлением в соответствии с законодательством, внесением записи в трудовую книжку) не имеется. В частности, по окончании срока действия трудового договора он должен быть прекращен по пункту 2 части первой статьи 77 Кодекса с внесением ответствующей записи в трудовую книжку работника.
При увольнении (в том числе и по пункту 2 части первой статьи 77 Кодекса) работнику выплачивается денежная компенсация за все неиспользованные отпуска (статья 127 Кодекса).
В дальнейшем с этим работником может быть заключен новый срочный трудовой договор, если для его заключения будут соответствующие основания. В этом случае в общем порядке следует издать приказ о приеме на работу и внести соответствующую запись о приеме на работу по новому срочному трудовому договору в трудовую книжку.
То есть следует прекратить трудовые отношения с генеральным директором, у которого окончился срочный трудовой договор в соответствии с требованием трудового законодательства, а именно издать приказ об увольнении в связи с истечением срока трудового договора и внести соответствующую запись в трудовую книжку. После чего вновь заключить срочный договор, издать приказ о приеме на работу о чем внести соотвествующую запись в трудовую книжку.