Добрый день — ТУТ бы желательно видеть текст проверяющих — областной Рофомс? акт уже подписан руководителем?
? Непонятен их правовой мотив что их не устроило — не оформили д/с к трудовому договору так мало информации для ответа трудно однозначно сказать вы ссылались в приказе на ст 60.2 ТК РФ почему сняли именно 0.5 ставки и не всю ставку? чем в вашем приказе было обосновано расширение зоны обслуживания по данной должности машинистки — на мой взгляд лучше было бы давать ставку — отсутствующего работника ...
Статья 60.2. Совмещение профессий (должностей). Расширение зон обслуживания, увеличение объема работы. Исполнение обязанностей временно отсутствующего работника без освобождения от работы, определенной трудовым договором
[Трудовой кодекс РФ] [Глава 10] [Статья 60.2]
С письменного согласия работника ему может быть поручено выполнение в течение установленной продолжительности рабочего дня (смены) наряду с работой, определенной трудовым договором, дополнительной работы по другой или такой же профессии (должности) за дополнительную оплату (статья 151 настоящего Кодекса).
Поручаемая работнику дополнительная работа по другой профессии (должности) может осуществляться путем совмещения профессий (должностей). Поручаемая работнику дополнительная работа по такой же профессии (должности) может осуществляться путем расширения зон обслуживания, увеличения объема работ. Для исполнения обязанностей временно отсутствующего работника без освобождения от работы, определенной трудовым договором, работнику может быть поручена дополнительная работа как по другой, так и по такой же профессии (должности).
Еще желательно увидеть Решение проверки Вашей организации.