Имеет ли военкомат основания для отмены отсрочки?

Здравствуйте, Евгений!
Согласно Федеральному закону от 28.03.1998 N 53-ФЗ (ред. от 15.02.2016) «О воинской обязанности и военной службе», ст. 24, пп. б, п. 1 отсрочка от воинской службы предоставляется лицам, занятым постоянным уходом за отцом, матерью, женой, родным братом, родной сестрой, дедушкой, бабушкой или усыновителем, если отсутствуют другие лица, обязанные по закону содержать указанных граждан, а также при условии, что последние не находятся на полном государственном обеспечении и нуждаются по состоянию здоровья в соответствии с заключением федерального учреждения медико-социальной экспертизы по месту жительства граждан, призываемых на военную службу, в постоянном постороннем уходе (помощи, надзоре).
В данном случае, толкуя данный пункт буквально, только лишь Ваш отец может являться иным лицом, обязанным по закону содержать Вашу мать, в том случае, однако, если бы он был один, и Вы не могли бы нести за ней уход.
Родители не обязаны по закону содержать Вашу мать, поскольку она достигла совершеннолетия, однако, на усмотрение военного комиссариата ее уход может признаваться уходом обязанного лица, а Ваша жена и вовсе не связана с ней родственными, или свойскими связями.
Также важно понять, что Ваша мать не должна находится на полном государственном обеспечении, то есть должна иметь работу и заработок (если она уже будет на полном государственном обеспечении — это не будет являтся основанием для отсрочки) и в Индивиуальной программе реабилитации и абилитации инвалида (ребенка-инвалида) в рекомендуемых мероприятиях должна быть фраза «нуждается в постоянном всестороннем уходе».
МСЧ и другие учреждения здравоохранения РФ не могут выдавать справки и Индивидуальные программы реабилитации и абилитации инвалида.
В данном случае, я полагаю, что отказ медицинской организации в выдаче направления Вашей матери незаконный, и Вы можете его обжаловать либо в Департамент здравоохранения по месту жительства, либо в суд в течение 3 лет с момента того, как Ваша мама узнала о нарушении своего права.