Здравствуйте, Ксения!
Трудовой кодекс РФ предусматривает обязанность работодателя предоставлять Вам как ученический отпуск, так и очередной ежегодный оплачиваемый отпуск.
При этом ст.122 ТК РФ конкретное время перед отпуском по беременности и родам не регулирует. Определенно сказано только про сроки предоставления отпуска после отпуска по беременности и родам (неспоредственно после..).
Полагаю, что Вы можете настаивать на представлении друг за другом: отпуска ежегодного, ученического и после них уже уходить в отпуск по беременности и родам.
Однако, убедитесь, что работодатель Вас правильно понял и издал приказы в соответствии с Вашими требованиями. В противном случае, Вы можете пропустить срок для обжалования действий работодателя в суд (в течение 3 месяцев с момента, когда Вы узнали о нарушении своих прав).