Предлагаю вам заключить с продавцом предварительный договор, в котором подробно обговорить ваши следующие действия:
Можно одновременно заключить договор залога второй квартиры и договор займа, по которому вы даете продавцу необходимый миллион на выплату банку. После снятия обременения с нужной вам квартиры вы оформляете ее покупку и расторгаете договор залога той квартиры.
Это достаточно длительно по времени и затратно, но максимально снижает риски.
Можно немного упростить ситуацию: вы просто вместе с ним ходите в банк, гасите его кредит, потом в Росреестр, гасите обременение и потом оформляете сделку. Это проще, но более рискованно, я бы рекомендовал так делать при определенной доли доверия к покупателю и наличия у вас юридической грамотности.
По вопросу списка документов, то он сейчас достаточно небольшой и включает правоустанавливающие документы на обе квартиры и кадастровые паспорта на квартиры, дополнительно: справки об отсутствии задолженности по коммуналке и особенно по взносам на капремонт, поквартирные карточки, свежие выписки из реестра недвижимости
Что касается предоставления займа, который будет обеспечен иной квартирой, то такая сделка имеет место быть.