Кирилл, здравствуйте.
В соответствии с пунктом 32 Положения о независимой военно-врачебной экспертизе один из трёх экземпляров заключения экспертизы направляется в военно-врачебную (врачебно-летную) комиссию, решение которой послужило основанием для обращения гражданина с заявлением о производстве независимой экспертизы, а при несогласии гражданина с результатами медицинского освидетельствования, проведенного в рамках работы призывной комиссии или комиссии по постановке граждан на воинский учет, — в военный комиссариат по месту воинского учета гражданина.
После поступления в военкомат независимого заключения может быть проведено контрольное обследование и повторное освидетельствование.
В случае несогласия Вами с заключение повторного освидетельствования Вы можете его обжаловать в суд.
Сергей Игоревич.
Спасибо, но основной вопрос был в том, можно ли взыскать с военкомата стоимость независимой экспертизы?
Можно, если обратитесь в суд с заявлением об оспаривании решения военкомата о признании Вас годным, и заявите требование о возмещении всех расходов.