Добрый день!
Согласно п. 17.1 ст. 217 НК РФ, не подлежат налогообложению доходы, получаемые физическими лицами за соответствующий налоговый период от продажи жилых домов, квартир, комнат, находившихся в собственности налогоплательщика три года и более.
Если с момента государственной регистрации права собственности на квартиру прошло более 3 лет, то платить НДФЛ не нужно. Дата государственной регистрации права собственности определяется не датой получения свидетельства о государственной регистрации, а датой внесения соответствующей записи в ЕГРП. Дата регистрации должна быть указана у Вас в свидетельстве о государственной регистрации.