Добрый день, Тимур.!
Налоговая в данной ситуации вообще ничего проверять не будет, если все налоги и сборы в Фонды ИП будет оплачивать вовремя. Да и даже если не будет оплачивать, то проблемы прежде всего у него будут, а не у вас.
Единственный вариант, при котором вами могут заинтересоваться, так это если у вас ИП будут работать массово, будут получать ежемесячную примерно одинаковую оплату в одни и те же числа, других доходов ИП иметь не будут, и зарегистрированы будут примерно в одно время (когда вы дружно всех работников в ИП перевели).
В таком случае может быть назначена проверка, по результатам которой гражданско-правовые договоры с ИП могут признать притворной сделкой, признать данные договоры максирующими трудовые договоры, донасчитать вам налоги, а также оштрафовать за занижение налоговой базы и сокрытие доходов (если ИП на патенте, упрощенке или ЕНВД будут, например).
Так что общий вывод: если будете «принимать на работу» ИП, то в принципе ничего страшного не случится. Но не делайте это массово и одновременно, иначе привлечете внимание, и вот тогда могут случиться трудности.
А так — практика достаточно распространенная!
Успехов вам!
И да — важное дополнение. Старайтесь не заключать с ИП договоры «под копирку». Каждый индивидуализируйте как-то. И лучше вообще заключите «рамочный» договор, согласно которому ИП обязуется выполнять такие-то работы (перечень возможных видов работ). А список конкретных работ, срок их выполнения и цена пусть согласовываются дополнительными спецификациями к договорам.
Это нужно для того, чтобы договоры были максимально далеки по содержанию от трудовых.