Приветствую, Кристина!
Если Вам откажут именно в связи со сложившимися обстоятельствами, то надо будет сначала узнать поточнее мотивировку отказа, а потом проверять его на соответствие закону. Пока проверять нечего.
Если Вы работаете по трудовому договору, то надо смотреть, какие условия в нем указаны. Вряд ли там указана обязанность работодателя учитывать Ваши пожелания по месту жительства и обязательно переводить Вас в филиал, если Вы захотите переехать. Скорее всего, трудовой договор предусматривает работу по конкретному адресу или в конкретном населенном пункте.
Тогда Вам можно только предложить работодателю перевести Вас в филиал, а если откажет в связи с отсутствием там необходимости в таком специалисте (нет такой должности или все заняты), то это законно.
А как работодатель отнесется к информации о Вашей беременности неизвестно. Может и постараться уволить, но прямо об этом не скажет, будет искать повод. Некоторые (не все), так делают. Тем более, в кризис.