Что делать, если командир не отпускает после окончания контракта с МО на СВО?

Здравствуйте, Руслан. Командир воинской части не имеет юридического права уволить вас по окончании срока контракта, так как в России продолжает действовать режим частичной мобилизации, при котором все контракты продлеваются автоматически.
Ваше желание завершить службу понятно, однако текущее законодательство жестко ограничивает возможность увольнения.

Юридическая сторона вопроса
Указом Президента Российской Федерации номер 647 «Об объявлении частичной мобилизации» установлено, что все контракты о прохождении военной службы, заключенные военнослужащими, продолжают свое действие до окончания периода частичной мобилизации.
Исключение из списков части по причине истечения срока контракта сейчас законодательно приостановлено. Даже если в вашем документе был указан конкретный срок (например, один год), этот контракт автоматически трансформируется в бессрочный до выхода официального указа Президента о завершении мобилизации. Командиру части не требуется заставлять вас подписывать новые бумаги или настаивать на продлении — закон делает это автоматически.

Законные основания для увольнения со службы
На сегодняшний день расторгнуть контракт и законно вернуться домой можно только по четырем строго определенным основаниям:
По состоянию здоровья: Признание военно-врачебной комиссией (ВВК) негодным к военной службе с присвоением категории «Д» (в некоторых случаях — категории «В» по социально значимым заболеваниям или тяжелым ранениям).
По возрасту: Достижение предельного возраста пребывания на военной службе (для большинства рядовых и сержантов контрактников этот порог составляет 65 лет).
В связи с вступлением в силу приговора суда: Назначение наказания в виде лишения свободы.
По семейным обстоятельствам: Возникновение исключительных причин, требующих постоянного ухода за близким родственником при отсутствии других лиц, обязанных это делать по закону (подтверждается заключением федерального учреждения медико-социальной экспертизы).

Что делать в вашей ситуации
Не совершайте самовольных действий: Ни в коем случае не покидайте расположение части самостоятельно по истечении календарного срока контракта. Это будет квалифицировано как самовольное оставление части (СОЧ) по статье 337 Уголовного кодекса РФ, что влечет за собой суровое уголовное наказание вплоть до реального лишения свободы.
Подайте рапорт по команде: Вы имеете право написать рапорт на имя командира части с просьбой рассмотреть возможность увольнения по окончании контракта. Командир будет обязан дать вам официальный письменный ответ, где сошлется на нормы указа о мобилизации.
Инициируйте прохождение ВВК при наличии травм: Если за время службы у вас ухудшилось здоровье, обострились хронические болезни или вы получили ранения, подавайте рапорт на направление вас на медицинскую комиссию для определения текущей категории годности. Это единственный реальный способ досрочно завершить службу по закону.