Максут, выбирать нужно по тому, как Вы действительно работаете. Если берёте самостоятельный заказ с конкретным результатом, обычно подходит договор подряда; если оказываете услуги без отдельного овеществлённого результата — договор услуг. Если же Вас принимают на постоянную должность с графиком и подчинением работодателю, нужен трудовой договор. Его нельзя заменить подрядом только ради самозанятости (ст. 15 Трудового кодекса РФ).
Чтобы защитить оплату по договору с заказчиком, письменно согласуйте задание и результат, сроки, цену, аванс, этапы, способ сдачи и приёмки, срок оплаты после сдачи и порядок направления замечаний. Например: «Заказчик оплачивает выполненный этап в течение 5 рабочих дней после подписания акта». Аванс надо прямо предусмотреть: по общему правилу оплата подряда производится после сдачи результата (ст. 711 ГК РФ). Договор и акты подписывайте с конкретным заказчиком, сохраняйте переписку и подтверждение передачи результата; после получения оплаты сформируйте чек в приложении «Мой налог».
Зарплата по трудовому договору не облагается налогом на профессиональный доход (ст. 6 Закона №422-ФЗ). Если заказчик — нынешний работодатель или бывший работодатель, с увольнения от которого прошло менее двух лет, налоговый режим для выплат от него нужно проверить отдельно.
Могу подготовить договор под Вашу работу с понятным порядком приёмки и оплаты. Для этого понадобятся описание работы, данные заказчика и согласованные цена и сроки.
Если понадобится помощь, напишите мне в личный чат Правовед.RU. Стоимость консультации и подготовки документов умеренная, конкретную сумму согласуем заранее с учётом объёма работы. Для связи нажмите «Общаться в чате» в моём профиле: pravoved.ru/lawyer/4537513/