Нужно ли платить налог при увеличении доли в квартире?

Здравствуйте!

Как вы последнюю долю получили?

Сам по себе факт приращения доли (например, когда вы получаете дополнительную долю в квартире — по наследству, договору дарения от родственника или в результате раздела имущества) не создаёт налоговой базы для уплаты НДФЛ. Ключевой момент: право собственности на сам объект не прекращается — меняется только размер доли. Поэтому для целей НДФЛ срок владения считается с момента, когда у вас впервые возникло право собственности на любую из этих долей, а не с даты, когда вы оформили новое, увеличенное право. 
А раз срок владения не обнулился, то и при продаже всей квартиры (или значительной её части) вы можете применить освобождение от НДФЛ, если прошёл минимальный срок владения. В большинстве случаев это 5 лет, но для некоторых ситуаций (например, если жильё было унаследовано, получено в дар от близкого родственника, приватизировано или являлось единственным) срок может быть 3 года. 
Важное уточнение: это работает, только если вы продаёте квартиру как единый объект. Если вы решите продать отдельно ту часть доли, которая появилась позже (например, раздельная продажа двух частей, которые раньше числились как самостоятельные доли), налоговая может посчитать это иначе. 
Когда может возникнуть вопрос? Например, если после приращения вы решите продать всю квартиру, и окажется, что с момента появления первой доли не прошло минимального срока — тогда доход от продажи будет облагаться налогом. Но сам факт приращения не создаёт нового налога, он лишь влияет на расчёт срока владения при последующей продаже. 
Мой совет: перед сделкой соберите все документы (основания появления каждой доли, выписки из ЕГРН) и покажите их налоговому консультанту или в ФНС. Специалист сверит даты и окончательно подтвердит, что все условия для освобождения от НДФЛ соблюдены.