Здравствуйте Марина.
Если отец детей официально числится пропавшим без вести, ситуация с ДНК регулируется специальными правилами государственной геномной регистрации.
Дети являются близкими биологическими родственниками пропавшего без вести лица, поэтому их геномный материал может использоваться для установления личности и поиска либо идентификации пропавшего человека. Для близких родственников пропавших без вести такая геномная регистрация предусмотрена как обязательная.
Если дети несовершеннолетние, забор биологического материала производится в присутствии их законного представителя.
Поэтому просто отказаться от проведения исследования только потому, что Вы не хотите объяснять детям его причину, скорее всего, не получится, если процедура назначена уполномоченным органом именно в рамках розыска пропавшего без вести.
Однако одного телефонного звонка из военкомата недостаточно, чтобы понять, кто именно и на каком основании назначил процедуру. Я бы рекомендовала попросить предоставить письменное направление или уведомление, где будут указаны орган, назначивший исследование, основание проведения, место сдачи материала и порядок процедуры.
При этом детям вовсе не обязательно подробно рассказывать об обстоятельствах исчезновения отца или о возможной гибели. Объяснение можно подобрать с учетом их возраста, например сказать, что проводится медицинское исследование, которое поможет специалистам найти их папу.
Если Вам выдадут письменное требование о сдаче ДНК, его можно дополнительно проверить на законность до прохождения процедуры.