Имею ли я право начать получать военную пенсию от военкомата?

Добрый день. Да, вы имеете право начать получать военную пенсию от военкомата. Ситуация, которую вы описали, не закрывает вам путь к такой пенсии. Ключевой момент — связь инвалидности со службой, а не факт уголовного дела или основания увольнения. 
Согласно статьям 19 и 20 Закона РФ от 12 февраля 1993 года № 4468-1 «О пенсионном обеспечении лиц, проходивших военную службу...», право на пенсию по инвалидности возникает, если инвалидность наступила:
в период прохождения военной службы; 
или не позднее трёх месяцев после увольнения со службы; 
или позднее этого срока, но вследствие ранения, контузии, увечья или заболевания, полученных в период прохождения службы. 
То, что в отношении вас было уголовное дело (которое впоследствии прекратили), само по себе не лишает права на военную пенсию. Закон смотрит на причину инвалидности, а не на прошлое уголовное преследование. Если комиссия ВВК установит, что увечье или заболевание связано со службой, условие закона будет выполнено. 
Что делать на практике
Подайте документы в военкомат. Обратитесь в военный комиссариат по месту жительства. Обычно личное дело после увольнения направляется туда кадровым органом. Понадобятся: заявление, выписка из приказа об увольнении, заключение военно-врачебной комиссии (ВВК), выписка из акта медико-социальной экспертизы (МСЭ) об инвалидности. 
Дождитесь решения. По правилам (Приказ Министра обороны РФ от 15 декабря 2023 года № 845) решение о назначении пенсии или об отказе должны принять в течение 10 рабочих дней после поступления полного пакета документов. 
Главное — не соглашаться с устным отказом. Вам обязаны направить письменное уведомление с мотивировкой (на какой статье закона основан отказ). С этим письменным отказом и собранным пакетом документов (паспорт, СНИЛС, справка об инвалидности, документы о службе) обращайтесь:
к руководству пенсионного органа военкомата (вышестоящему должностному лицу);
при необходимости — в суд.
В суде вы сможете оспорить решение, сославшись на те же нормы закона (в первую очередь на ст. 19–20 Закона № 4468-1) и представив доказательства связи инвалидности со службой (заключение ВВК). 

Добрый день! 

Право на военную пенсию по инвалидности у вас, скорее всего, есть, но её назначение не отменяет выплату от СФР автоматически. Вам нужно подать заявление в военкомат, и, если откажут, обжаловать это решение в вышестоящем органе или суде.

Разбираем вашу ситуацию по шагам 1. Основание для военной пенсии
Ключевой факт в вашем вопросе — «уволен по льготному основанию, кат Д» и наличие 2 группы инвалидности. Согласно Закону РФ № 4468-1, право на пенсию по инвалидности имеют офицеры, уволенные с военной службы, при наличии инвалидности, наступившей в период службы или не позднее 3 месяцев после увольнения. Категория «Д» (негоден) — это как раз льготное основание. Само по себе прекращение уголовного дела (снятие соч) не лишает вас этого статуса, если оно не связано с формулировкой увольнения, порочащей честь военнослужащего. Вам нужно проверить формулировку в приказе об увольнении.

2. Одновременное получение двух пенсий
Здесь важный нюанс. По общему правилу, военные пенсионеры не могут получать одновременно две пенсии по инвалидности (одну от СФР, вторую от военкомата). Вам придётся выбрать одну. Однако, если ваша инвалидность связана с военной травмой, военная пенсия может быть существенно выше. Вам нужно сравнить размеры, прежде чем отказываться от СФР.

3. Куда обращаться
За военной пенсией нужно идти в военный комиссариат (военкомат) по месту жительства. Именно он назначает и выплачивает пенсии уволенным военнослужащим. При себе нужно иметь: паспорт, военный билет (с записью об увольнении), справку об инвалидности (МСЭ), документы о прекращении уголовного дела и т.д.

 Что делать, если откажут
Если военкомат откажет, не опускайте руки. У вас есть чёткий алгоритм действий:

Получите письменный отказ. Требуйте его обязательно, с указанием причины и ссылкой на закон.
Обжалуйте в вышестоящий военкомат. Отказ районного военкомата можно обжаловать в региональном (областном, краевом) военном комиссариате.
Обратитесь в суд. Это самый действенный путь. Вы можете подать административный иск в гарнизонный военный суд (или районный суд, если военного суда нет) с требованием признать отказ незаконным и обязать военкомат назначить пенсию. Судебная практика часто встаёт на сторону военных пенсионеров, если увольнение и инвалидность подтверждены документально.
Прокуратура. Жалоба в военную прокуратуру также может помочь, но обычно она не разрешает спор по существу, а только проверяет законность действий. Суд здесь эффективнее.
Чем руководствоваться (правовая база)
Вам стоит ссылаться на:

Закон РФ от 12.02.1993 № 4468-1 «О пенсионном обеспечении лиц, проходивших военную службу…» (статьи о пенсии по инвалидности).
Постановление Правительства РФ о порядке исчисления выслуги лет и назначения пенсий.
Ваше личное дело и приказ об увольнении (главный документ, где указано основание).
Справка МСЭ об установлении 2 группы инвалидности.

Если Вы удовлетворены качеством моей консультации, буду благодарна за положительный отзыв о моей работе на сайте. 

 Удачи Вам!