Здравствуйте! В общем случае можно иметь два прибора учёта: отдельный на дом и отдельный на полив, а при наличии отдельного отвода на полив после ввода такого счётчика в эксплуатацию плата по нему начисляется только за холодное водоснабжение, без водоотведения. Федеральные правила также допускают определять объём сточных вод не только по прибору учёта сточных вод, но и по согласованному балансу водопотребления и водоотведения, то есть учитывать, что часть воды уходит не в канализацию, а на полив. Если Водоканал теперь возражает, попросите у него письменный отказ с указанием конкретного пункта договора и нормы, на которую он ссылается. Затем подайте заявление о согласовании отдельной линии полива, опломбировке второго счётчика и внесении изменений в договор/схему учёта; если уже всё было согласовано раньше, приложите прежние акты и квитанции.
Если отдельную схему учёта не оформят, Водоканал, как правило, будет считать водоотведение со всего объёма воды, прошедшего через один общий счётчик. Поэтому ваша задача сейчас — не спорить устно, а добиваться письменного оформления второго счётчика или письменного отказа для дальнейшего обжалования.