Здравствуйте, Темирлан.
Да, вы можете въехать. Наличие договора с российским вузом на очное обучение — это как раз то самое законное основание, которое позволяет продлить срок пребывания в России сверх лимита в 90 дней. То есть сам по себе факт, что вы уже использовали 90 дней как турист, не закрывает вам дорогу: учёба «перекрывает» это ограничение.
При въезде в миграционной карте в графе «цель въезда» укажите «учёба».
Сразу после въезда обратитесь в территориальное подразделение МВД (часто этим помогает международный отдел самого вуза) с договором и другими документами, чтобы продлить срок пребывания. На основании ходатайства вуза срок продлевают на период обучения.
Если помог Вам, буду признателен за положительную оценку (зелёный плюс под ответом).
Всего доброго.