Что делать, если отец записал на себя двоих детей при наличии одной совместной дочери?

Начну с главного: сама оспорить эти записи Вы не сможете. Право требовать оспаривания отцовства - строго ограниченный круг лиц по ст. 52 СК РФ: сам мужчина, записанный отцом, мать этих конкретных детей, сами дети по достижении 18 лет, либо их опекун. Вы как мать другой дочери в этот перечень не входите - у Вас просто нет права на такой иск в отношении не Ваших детей.

Дальше неприятная часть: если отцовство зарегистрировано в ЗАГСе (он добровольно признал этих детей своими и записан в их свидетельствах о рождении), то юридически это его дети, и в силу ст. 1142 ГК РФ все трое детей - наследники первой очереди в равных долях. То же касается любых положенных выплат, если он военнослужащий и пропал без вести на СВО (единовременные, страховые выплаты - они распределяются между всеми детьми поровну, независимо от того, состоял он в браке с их матерями или нет, и национальности значения не имеет). То есть само по себе наличие этих двух детей права Вашей дочери не нарушает - закон одинаково защищает всех детей отца.

Но есть нюанс: если у Вас реально есть основания считать, что он не биологический отец этим детям (например, физически не мог им быть по датам/обстоятельствам), это может использовать в суде либо он сам, либо мать этих детей, либо сами дети позже. Со стороны Вашей дочери путь другой - защищать её долю в наследстве/выплатах, следить за правильностью распределения, и при необходимости оспаривать не сам факт отцовства, а размер/порядок начисления доли, если он нарушен.

Ключевой процессуальный вопрос сейчас - статус самого отца: пропал без вести (нужна ли процедура признания безвестно отсутствующим/умершим для открытия наследства и выплат) - от этого зависит вся дальнейшая стратегия защиты интересов дочери.