Если происходит продажа объекта недвижимости, доли в праве собственности на которую приобретены в разное время, то срок нахождения недвижимости в собственности считается по дате первоначальной госрегистрации права собственности на первую из долей (см. письмо Минфина России от 13.01.2015 № 03-04-05/69528, письмо ФНС России от 26.07.2016 № БС-4-11/13524@).
Однако срок владения, освобождающий от уплаты НДФЛ, разный (3 или 5 лет) в зависимости от оснований приобретения права собственности. Если идет речь о наследовании, приватизации, дарении между близкими родственниками, ренте, или если жилье единственное — 3 года, по иным основаниям (например, купля-продажа) — 5 лет.