Да, разъясню вашу ситуацию с позиции законодательства.
Короткий ответ: Да, организация, предоставляющая коммунальные услуги (Водоканал), имеет право сделать перерасчет за прошедший период, а не только с момента обнаружения ошибки.
Водоканал действует в рамках закона, производя перерасчет. Ваша обязанность как собственника/нанимателя — оплачивать коммунальные услуги, рассчитанные в соответствии с установленными правилами. Поскольку ранее расчет велся по неверному параметру, вам правомерно доначислили разницу, но только за период, не превышающий 3 лет с момента обнаружения ошибки.
Ваши дальнейшие действия должны быть направлены на проверку корректности расчета и соблюдения сроков, а не на оспаривание самого права на перерасчет. Ваш случай подпадает под действие пункта 61 Правил предоставления коммунальных услуг собственникам и пользователям помещений в многоквартирных и жилых домах (утв. Постановлением Правительства РФ №354).