Или же данная сделка будет просто как сделка между физлицами?

Здравствуйте.

Так как вы продали имущество по цене покупки, формально отсутствует доход, с которого можно было бы уплатить НДФЛ. Однако, учитывая статус ИП ГКФХ и возможное использование недвижимости в предпринимательской деятельности, необходимо учитывать следующее.
 Налогообложение при продаже имущества ИП ГКФХ:

 Если имущество использовалось в предпринимательской деятельности ИП ГКФХ, то доход от его продажи облагается налогами в соответствии с применяемым режимом налогообложения ИП.
НДС:

Поскольку вы являетесь плательщиком НДС, то продажа имущества, использовавшегося в предпринимательской деятельности, облагается НДС (пп. 1 п. 1 ст. 146 Налогового кодекса РФ). Базой для начисления НДС будет являться стоимость реализации имущества.

Налог на доходы (в зависимости от системы налогообложения): Общая система налогообложения (ОСНО): Доход от продажи имущества включается в налоговую базу по НДФЛ (13% или 15% в зависимости от размера дохода) и облагается налогом. Имущественный вычет в данном случае не применяется (п. 17.1 ст. 217 НК РФ).

Также, с суммы прибыли (разница между ценой продажи и ценой покупки) уплачивается НДФЛ. Так как вы продали по цене покупки, то прибыли нет.

 Доход от продажи имущества облагается налогом по ставке, установленной для УСН (6% с доходов или 15% с разницы «доходы минус расходы»).
Единый сельскохозяйственный налог (ЕСХН): Доход от продажи имущества облагается налогом по ставке, установленной для ЕСХН (6% с разницы «доходы минус расходы»).

 Доказательство использования в предпринимательской деятельности: Налоговые органы могут запросить документы, подтверждающие использование земельного участка и картофелехранилища в предпринимательской деятельности ИП ГКФХ (например, договоры с поставщиками, покупателями, арендаторами, бухгалтерскую отчетность, документы на сельхозтехнику и т.п.).

 Налоговые органы могут обратить внимание на сделку между взаимозависимыми лицами (отцом и сыном), особенно если цена продажи значительно отличается от рыночной. В этом случае могут быть доначислены налоги исходя из рыночной стоимости имущества (ст. 105.3 НК РФ).

Однако, в вашем случае цена продажи равна цене покупки, что снижает риск претензий со стороны налоговых органов.
Важно, чтобы имущество было оформлено на физлицо до начала использования в предпринимательской деятельности в качестве ИП ГКФХ. В противном случае, налоговые последствия будут иными.
  Рекомендации:

 Подготовьте документы, подтверждающие приобретение имущества как физическое лицо: Договор купли-продажи, свидетельство о регистрации права собственности (выписку из ЕГРН) на имя физлица.
Сохраните документы, подтверждающие использование имущества в предпринимательской деятельности ИП ГКФХ: Это могут быть договоры аренды, договоры с поставщиками/покупателями, документы об учете урожая и т.д.
Обратитесь за консультацией к налоговому консультанту или юристу, специализирующемуся на налоговом праве: Он сможет оценить вашу ситуацию с учетом всех нюансов и дать более точные рекомендации.

 В вашей ситуации, несмотря на продажу имущества по цене покупки, необходимо учитывать статус продавца как ИП ГКФХ и возможное использование недвижимости в предпринимательской деятельности.

Вероятнее всего, сделка будет рассматриваться с точки зрения налогообложения ИП. Вам необходимо подтвердить факт использования имущества в предпринимательской деятельности и уплатить НДС с суммы реализации. Вопрос о НДФЛ/налоге по УСН/ЕСХН будет зависеть от выбранной системы налогообложения и наличия прибыли (разницы между ценой продажи и ценой покупки).

С уважением Светлана Б

Здравствуйте!

Это не будет считаться сделкой между обычными физлицами. Так как имущество использовалось в предпринимательской деятельности, продавец обязан выступить в статусе ИП Главы КФХ и заплатить налоги.

Поскольку недвижимость (картофелехранилище и земля) использовалась в предпринимательской деятельности, продажа не подпадает под освобождение от НДФЛ по сроку владения (3 или 5 лет). Норма п. 17.1 ст. 217 НК РФ указывает, что доходы от продажи имущества, использовавшегося в предпринимательской деятельности, не освобождаются от налогообложения (за исключением жилых помещений, но хранилище и с/х земля к ним не относятся).

Сделка квалифицируется как предпринимательская. Доход от нее включается в налоговую базу ИП.

тк являемся плательщиками ндс

Согласно пп. 6 п. 2 ст. 146 НК РФ

В целях настоящей главы не признаются объектом налогообложения:

операции по реализации земельных участков (долей в них);

То есть при продаже земли сыну Вы не должны начислять НДС сверху или выделять его из цены. В договоре стоимость земли прописывается «Без НДС». Счета-фактуры выставляются с пометкой «Без налога (НДС)».

Здание (сооружение) является объектом обложения НДС в общем порядке (п. 1 ст. 146 НК РФ). Если в договоре указано, что цена равна цене покупки (например, 1 млн руб.) и не оговорено, что НДС сверху, то считается, что налог уже сидит внутри этой суммы. Вам придется отдать государству 20/120 от полученной суммы.

В договоре лучше разделить цену, отдельно указать цену земли, здания, НДС.

Недвижимость в данной сделке была продана, по цене покупки

Налоговые последствия зависят от Вашей системы налогообложения. Исходя из того, что Вы плательщик НДС, вероятнее всего Вы на ОСНО, либо на ЕСХН.

Если Вы на ОСНО (платите НДФЛ как ИП), это самый выгодный вариант в Вашем случае. Согласно ст. 221 НК РФ, ИП имеет право на профессиональный налоговый вычет в сумме фактически произведенных и документально подтвержденных расходов. Даже если имущество покупалось до регистрации ИП (на физлицо), но использовалось в предпринимательской деятельности, Вы имеете право уменьшить доход от продажи на сумму расходов по его покупке. Налоговая база по НДФЛ будет равна нулю, налог платить не нужно.

Если Вы на ЕСХН, на ЕСХН расходы на приобретение основных средств списываются (учитываются) в момент ввода в эксплуатацию и оплаты. Если Вы уже учли стоимость хранилища в расходах в прошлые годы (когда покупали или переходили на спецрежим), то сейчас, при продаже, Вы не можете вычесть стоимость покупки повторно. В этом случае вся сумма продажи пойдет в доход, и с нее придется заплатить 6% (ст. 346.5 НК РФ).

Сделка между родителями и детьми признается сделкой между взаимозависимыми лицами (ст. 105.1 НК РФ).

Если Вы продаете по цене покупки, а рыночная цена за эти годы выросла в разы, налоговая может посчитать это занижением налоговой базы. Поскольку Вы являетесь плательщиками НДС, налоговики теоретически могут доначислить НДС с рыночной цены, а не с договорной (хотя для малого бизнеса этот риск ниже, чем для крупных холдингов, но он есть согласно ст. 54.1 НК РФ). Если цена покупки примерно соответствует текущей рыночной (или кадастровой), рисков нет. Если кадастровая стоимость сильно выше цены сделки — это красный флаг для ФНС.

Составляйте договор купли-продажи от имени ИП Главы КФХ (Продавец) физлицу (Покупатель). Обязательно выделите отдельно стоимость земли и здания. На землю НДС не начисляйте (ст. 146 НК РФ). На здание начислите и уплатите в бюджет, выставив счет-фактуру. Если Вы на ОСНО, подайте декларацию 3-НДФЛ, где укажите доход от продажи и заявите вычет в размере расходов на покупку (нужны сохранившиеся договоры и платежки о покупке). Налог к уплате будет 0.
Если Вы на ЕСХН, проверьте, списывали ли Вы расходы на это здание ранее. Если да — налог придется платить со всей суммы.