Могут ли изменить ВУС на оператора ЭВМ по запросу военкомата?

Приказом Министра обороны РФ  от 22.11.2021 N 700 «Об утверждении Инструкции об организации работы по обеспечению функционирования системы воинского учета»

определены требования внесения данных о ВУС в военный билет.

При наличии у военнообязанного нескольких гражданских специальностей в первую очередь записываются те из них, которые являются родственными ВУС.
Военно-учетные признаки, указываемые в пунктах 23 — 27, определяются и уточняются начальниками отделений военных комиссариатовна основании сведений, имеющихся в военном билете: об образовании; о гражданских специальностях;

Присвоить Вам ВУС «Оператор Эл. вычислительных механизмов» могут только в соответствии с кодом Вашей специальности согласно документа об образовании.

С учетом указанного момента Вам могут изменить ВУС.

Образование специализация бух учет с возможностью работы в 1С

Ильяс, если у Вас та специальность, что указана по тексту вопроса — изменить ВУС вполне возможно, как и указал выше. 

На данный момент у меня образование "Оператор Эл. вычислительных машин специализация Бух. учет",

Если же специализация именно бух. учет то он не совсем родственен ВУСу 600543, на который планируется поменять Ваш ВУС. Тем не менее, представляется, что изменение возможно. И обжалование вряд ли приведет к каким-либо результатам.