Чем грозит данная ситуация, какие последствия могут быть?

Здравствуйте! В сложившейся ситуации, когда военнослужащий был временно признан отсутствующим без уважительных причин (СОЧ), основная опасность — возможность привлечения к дисциплинарной ответственности, включающей выговор, строгий выговор, понижение в должности или увольнение по отрицательным основаниям. В более тяжёлых случаях возможно возбуждение уголовного дела по статье 337 Уголовного кодекса РФ за самовольное оставление части, если установят отсутствие по неуважительным причинам свыше двух суток. Однако ваши документы (рапорт, выписки, отметки о больничном) фиксируют уважительную причину отсутствия, а значит, вы вправе на них ссылаться и оспаривать привлечение к ответственности.

Также согласно Федеральному закону “О статусе военнослужащих” от 27.05.1998 N 76-ФЗ, пребывание на лечении и последующий больничный могут считаться уважительной причиной отсутствия на службе. Снижение или прекращение выплат допустимо лишь при нарушениях, доказанных по итогам служебного разбирательства. Вам следует подготовить копии всех подтверждающих документов, обращаться с рапортами о разъяснении статуса и выплат, а также получить письменные разъяснения командования. Если ситуация не прояснится — возможно обращение в военную прокуратуру.

Рекомендую не пугаться, собирать все документы и официально фиксировать все свои обращения в письменном виде — это поможет защитить ваши права.