Добрый день Анастасия! Отказа не будет, т.е. если и будет, то неправомерный.
Согласно:
Постановления Пленума ВАС РФ от 30.07.2013 г. № 61 п. 4. Учитывая, что адрес юридического лица определяется местом нахождения его постоянно действующего исполнительного органа, а в случае отсутствия постоянно действующего исполнительного органа — иного органа или лица, имеющих право действовать от имени юридического лица без доверенности (пункт 2 статьи 54 ГК РФ), и может отличаться от адреса, по которому осуществляется непосредственная деятельность юридического лица, в том числе хозяйственная (производственный цех, торговая точка и т. п.), регистрирующий орган не вправе отказывать в государственной регистрации на основании того, что помещение или здание, адрес которого указан для целей осуществления связи с юридическим лицом, непригодно для осуществления деятельности юридического лица в целом либо вида деятельности, который указан в документах, представленных для государственной регистрации. В то же время регистрация по адресу жилого объекта недвижимости допустима только в тех случаях, когда собственник объекта дал на это согласие; согласие предполагается, если названный адрес является адресом места жительства учредителя (участника) или лица, имеющего право действовать от имени юридического лица без доверенности.
В приложении Вам в помощь письмо одного из региональных УФНС России с аналогичной позицией, ответ давался по моему запросу.
Отказ вероятно будет, но возможно если оспаривать и ссылаться на то, что предоставил юрист Быков действительно изменит решение налоговой.