Здравствуйте! Нет, не может.
Согласно п. 7 ст. 10 ФЗ Федерального закона от 27.05.1998 N 76-ФЗ «О статусе военнослужащих» он не вправе заниматься коммерческой деятельностью, в том числе участвовать в управлении коммерческими организациями.
заниматься предпринимательской деятельностью лично или через доверенных лиц, в том числе участвовать в управлении коммерческими организациями, за исключением случаев, когда непосредственное участие в управлении указанными организациями входит в должностные обязанности военнослужащего, а также оказывать содействие физическим и юридическим лицам в осуществлении предпринимательской деятельности, используя свое служебное положение;
Военнослужащий может быть учредителем ООО, если это не влечет конфликт интересов. В противном случае доля участия, которая в данной ситуации составляет 100%, должна быть передана в доверительное управление. А вот оставаться генеральным директором не получиться.