С частью заключил новый контакт, но проводить приказами отказываются, с ссылаясь на контракт от Академии на указ 647

Добрый день.

Так же указывают, что за подписание первого контакта положена эта выплата

 Так выплата ему действительно не положена.

Основания для региональной выплаты определены в указе  Президента РФ от 31.07.2024 N 644  «О единовременной денежной выплате военнослужащим, проходящим военную службу по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации, войсках национальной гвардии Российской Федерации»

согласно которому из числа получателей выплаты исключены военнослужащие, замещающие воинские должности курсантов военных профессиональных образовательных организаций, военных образовательных организаций высшего образования, находящихся в ведении Министерства обороны Российской Федерации.

Аналогичное условие было определено и указом Президента РФ от 02.11.2022 N 787.

При этом после его отчисления он заключает не первый, а новый контракт, что также исключает возможность получения федеральной выплаты.

Согласно ст. 9 Положения о порядке прохождения военной службы 

1. Военнослужащий, проходящий военную службу по контракту и желающий продолжить ее прохождение, заключает новый контракт в следующих случаях:
в) при отчислении из военно-учебного заведения, адъюнктуры, военной докторантуры;

Ввиду того, что до отчисления из военного учебного заведения он уже проходил военную службу по контракту, то при заключении с ним нового контракта у него нет оснований для получения «президентской» единовременной выплаты.

На этот счет, например, Апелляционное определение Южного окружного военного суда от 06.09.2024 N 33а-1002/2024 (УИД 61GV0019-01-2024-000344-12) указывало, что действующее законодательство обеспечивает непрерывность прохождения военной службы по контракту; прекращение действия прежнего контракта и заключение нового контракта обусловлены необходимостью продолжения военнослужащим военной службы, а не поступлением его на военную службу вновь.

Здравствуйте, Мария Юрьевна!

указано прикатил свое действие . 

Тут необходимо понимать, что какие-либо надписи на бланке контракта о прохождении военной службы не предусмотрены. И что бы не было на нем написано, он, согласно указа Президента РФ № 647 от 2022 г., считается продленным.

Сыну была бы положена выплата, если бы он был уволен из ВС РФ. И после этого заключил бы контракт о прохождении военной службы.

В данном случае он был переведен после отчисления из ВУЗа.

Согласно указа Президента РФ от 2 ноября 2022 г. N 787 «О единовременной денежной выплате военнослужащим, проходящим военную службу по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации, войсках национальной гвардии Российской Федерации»

Установить гражданам Российской Федерации, призванным на военную службу по мобилизации в Вооруженные Силы Российской Федерации, военнослужащим, проходившим военную службу по призыву в Вооруженных Силах Российской Федерации (за исключением военнослужащих, замещающих воинские должности курсантов военных профессиональных образовательных организаций, военных образовательных организаций высшего образования, находящихся в ведении Министерства обороны Российской Федерации), ..., иным гражданам Российской Федерации, которые заключили в период проведения специальной военной операции контракт о прохождении военной службы в Вооруженных Силах Российской Федерации, войсках национальной гвардии Российской Федерации сроком на один год и более, и иностранным гражданам, которые заключили в период проведения специальной военной операции контракт о прохождении военной службы в Вооруженных Силах Российской Федерации сроком на один год и более, единовременную денежную выплату в размере 195 тыс. рублей.

Как видите, он не распространяется на военнослужащих по контракту, коим в момент подписания контракта являлся Ваш сын.

Таким образом, указанную выплату он получить не сможет.