Здравствуйте.
Собственно, у Вас возник доход ввиду чего Вы обязаны уплатить НДФЛ с суммы дохода. Правда учитывая, что в договоре на приобретение экскаватора у Вас стоит сумма в 100 т.р., Вам проще воспользоваться вычетом в размере 250 т.р. (пп. 1 п. 2 ст. 220 НК РФ). В этом случае Вы уплатите налог с суммы в размере 2 250 000 рублей.
Тот факт, что Вы не ставили технику на учет никак на Ваши налоговые обязательства не влияет, поскольку главное в этой части — наличие дохода, который у Вас имеется, исходя из Ваших данных в сумме 2 500 000 рублей. Соответственно Вы можете воспользоваться имущественным вычетом в указанной сумме и уплатить налог с меньшей суммы, чем если бы Вы воспользовались вычетом в размере расходов на приобретение.
Если Вам потребуется дополнительная консультация по этому вопросу и/или составление документов, либо возникнут иные правовые вопросы, Вы можете обратиться ко мне в чат за персональной консультацией.
Да, прошу прощения, не заметил, что трехлетний срок владения прошел.
Безусловно, на основании п. 17.1 ст. 217 освобождаются от налогообложения доходы, получаемые физическими лицами за соответствующий налоговый период от продажи имущества, не являющегося недвижимостью, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более.
Но возможно, Вам придется доказывать владение более трех лет, поскольку Вы не регистрировали его на себя надлежащим образом, а также есть вопрос относительно того, были ли Вы ИП во время приобретения, поскольку обычно физические лица спецтехникой не владеют.