При этом этот вопрос по детям судом вообще не будет рассматриваться, и если истец (супруга) явится в

В общем как я понял помощника судьи из телефонного разговора — максимум что я могу сейчас сделать это подать в это заседание своё заявление о том что с расторжением брака я не согласен и в настоящее время имеется спор о месте проживания детей.

 Вы, конечно, можете подать встречный иск об определении места жительства детей с Вами, но вполне возможно, что мировой судья откажет в принятии данного иска к производству и разъяснит Вам право обращения с данными исковыми требованиями в районный суд, т.к. раздельное разрешение этих требований вполне возможно.

 Так, согласно ст. 137 Гражданского процессуального Кодекса РФ:

Ответчик вправе до принятия судом решения предъявить к истцу встречный иск для совместного рассмотрения с первоначальным иском. 

 Причём, отказ в принятии встречного иска к производству не может быть обжалован, поскольку  такой отказ не является препятствием для обращения в суд с самостоятельным иском.

При этом, так как рассмотрение дела о расторжении брака согласно ст.23 ГПК РФ  рассматривается мировым судьей, то объединить к этому делу Ваши требования об определении места жительства детей с Вами не получится, поскольку это дело должно быть рассмотрено в районом суде, а не мировым судьей, поскольку согласно ст. 23 ГПК РФ 

Мировой судья рассматривает в качестве суда первой инстанции дела:

2) о расторжении брака, если между супругами отсутствует спор о детях;

Мировой судья откажет в принятии данного требования, мировой судья будет рассматривать только требование о расторжении брака.

Поэтому требование об определении места жительства детей с Вами Вы можете уже заявить в районный суд, подав туда исковое заявление. 

По поводу определения места жительства детей с Вами, также согласно ст. 65 СК РФ 

суд учитывает привязанность ребенка к каждому из родителей, братьям и сестрам, возраст ребенка, нравственные и иные личные качества родителей, отношения, существующие между каждым из родителей и ребенком, возможность создания ребенку условий для воспитания и развития (род деятельности, режим работы родителей, материальное и семейное положение родителей и другое).

Это также необходимо иметь в виду.

Кроме того, что касается бабушки, она тоже имеет право на общение с детьми, в силу ст. 67 СК РФ.

И также согласно ч. 2 ст. 67 ГПК РФ 

В случае отказа родителей (одного из них) от предоставления близким родственникам ребенка возможности общаться с ним орган опеки и попечительства может обязать родителей (одного из них) не препятствовать этому общению.

А по срокам рассмотрения дела о расторжении брака мировым судьей, если срок, который можно было продлить уже никак не продлить, в том числе, если суд уже давал срок для примирения сторон согласно ст. 153.1 ГПК РФ, откладвал разбирательство дела в соответствии со ст. 169 ГПК РФ, то суд вынесет решение до конца года. 

У Вас же в любом случае есть право апелляционного обжалования. Если вынесен суд заочное решение суда, в соответствии со ст. 237 ГПК РФ Вы имеете право подать заявление об отмене этого решения суда в течение семи дней со дня вручения Вам копии этого решения. 

 Также, если решение не отменят, что вероятнее всего, то можете подавать апелляционную жалобу в течение одного месяца со дня вынесения определения суда об отказе в удовлетворении заявления об отмене этого решения суда.