Здравствуйте.
Согласно положениям ч.1 ст. 26 ЖК перепланировка жилого помещения в многоквартирном доме проводиться с согласия органа местного самоуправления.
Для получения такого согласия собственник помимо прочих документов должен подготовить проект перепланировки помещения в многоквартирном доме.
Соотвественно отвечая на ваш вопрос:
Не выйдет ли мне при продаже доли это боком?
Боком выйдет только в том случае, если перепланировку проведет до того момента как вы продадите свою долю и результате этой перепланировки будет уменьшена ваша площадь.
Соответсвенно, давать согласие на перепланировку помещения я все же не рекомендую. Поскольку вы итак планируете продать свою долю, соотвественно в перспективе у вас нет интереса к этой перепланировке.
Таким образом, вам лучше сейчас направить второму собственнику письменное уведомление о том что вы хотите продать свою долю. С момента получения уведомление у второго собственника будет месяц на принтятие решения.
При этом обратите внимание — у второго сособственника есть преимущественное право покупки.
То есть сначала Вы должны предложить ему купить долю на тех же условиях, что и третьему лицу.
И если он не купит — тогда уже продавать иным лицам.
Статья 250 ГК РФ Преимущественное право покупки
Поэтому сперва может быть и стоит продать долю, а потом уже пусть делает перепланировку.
Проблема может быть такая — он выполнит перепланировку с нарушениями, не узаконит, и покупатели просто откажутся от приобретения.
А процесс приведения в соответствие может затянуться.