Здравствуйте.
Налоговые органы при проведении камеральных налоговых проверок деклараций по форме 3-НДФЛ осуществляют зачет уплаченного за рубежом налога на доходы физических лиц в порядке, установленном статьей 232 НК РФ.
Для заполнения декларации 3-НДФЛ с применением прораммного комплекса следует сначала проверить используете ли Вы его последнюю версию.
Если да, и в программном комплексе, который используется для заполнения декларации 3-НДФЛ обнаружена техническая проблема, не позволяющая учесть для зачета сумму, которая уплачена в Республике Армения в виде подоходного налога, исходя из повышенной ставки НДФЛ в РФ с сумм дохода, превышающих 5 млн рублей (с учетом того, что в РА был уплачен налог в размере 20%), то по всей вероятности для того, чтобы провести полноценный зачет на всю законодательно разрешенную сумму, Вам придется заполнить налоговую декларацию от руки и направить ее в письменной форме с приложением документов, подтверждающих возможность применения зачета.
Если Вам потребуется дополнительная консультация по этому вопросу и/или составление документов, либо возникнут иные правовые вопросы, Вы можете обратиться ко мне в чат за персональной консультацией.