Анна!
Полагаю, что Ваш случай вполне подходит под указанный в данной статье вариант, учитывая положения п.2.1 статьи 217.1 Налогового Кодекса РФ, в котором сказано так:
2.1. Доход от продажи объекта недвижимого имущества в виде комнаты,… освобождается от налогообложения независимо от срока нахождения в собственности налогоплательщика продаваемого жилого помещения или доли в праве собственности на жилое помещение, если одновременно соблюдаются следующие условия:
налогоплательщик и (или) его супруг (супруга) являются родителями (усыновителями) не менее двух детей, не достигших возраста 18 лет (24 лет, если дети являются обучающимися по очной форме обучения в организациях, осуществляющих образовательную деятельность),
Данное условие соблюдено — у Вас двое детей соответствующего возраста, один обучается очно в ВУЗе.
в календарном году, в котором осуществлена государственная регистрация перехода права собственности от налогоплательщика к покупателю на проданное жилое помещение или долю в праве собственности на жилое помещение, либо не позднее 30 апреля следующего календарного года налогоплательщиком (членами его семьи, указанными в абзаце втором настоящего пункта) на основании договора купли-продажи (договора мены) приобретено иное жилое помещение ...
Это условие будет выполнено, если Вы приобретёте новое жилое помещение не позднее 30 апреля следующего года.
общая площадь приобретенного жилого помещения… превышает соответственно общую площадь в проданном жилом помещении или его кадастровую стоимость, определяемые с учетом совокупного размера долей налогоплательщика и членов его семьи, указанных в абзаце втором настоящего пункта;
Как видно, Вы планируете купить квартиру с большей площадью, то есть и данное условие будет выполнено.
кадастровая стоимость проданного жилого помещения независимо от размера продаваемой доли налогоплательщика в соответствующем праве собственности не превышает 50 миллионов рублей (если кадастровая стоимость может быть определена);
Полагаю, что данное условие также может быть соблюдено, вряд ли Вы планируете купить более дорогое жилое помещение (по кадастровой стоимости).
налогоплательщику, его супругу (супруге), его детям (в том числе усыновленным), не достигшим возраста 18 лет, его родителям (если налогоплательщик является лицом, не достигшим возраста, указанного в абзаце втором настоящего пункта) на дату государственной регистрации перехода права собственности от налогоплательщика к покупателю на проданное жилое помещение или долю в праве собственности на жилое помещение не принадлежит в совокупности более 50 процентов в праве собственности на иное жилое помещение с общей площадью, превышающей общую площадь в приобретенном жилом помещении, независимо от размера приобретаемой доли налогоплательщика в соответствующем праве собственности.
У Вас есть ещё одна квартира, но по площади она не превышает указанные в данном пункте нормы, что также говорит в пользу использования Вами льготы при налогообложении доходов от продажи квартиры.
Если мои рассуждения верны, то Вы вправе не платить налог по доходам от продажи меньшей по площади квартиры в Санкт-Петербурге, если реально улучшите жилищные условия своей семьи в пределах предусмотренных законом сроков.
Между покупкой квартиры в СПб и квартиры в Кургане прошло более 3 месяцев? Квартирой в СПб владеете более 3 лет?