Если в нее вложен материнский капитал?

Если квартира куплена в период брака на общие средства супругов, а также с использованием средств мат.капитала, она является общим совместным имуществом супругов в соответствии со ст. 34 СК РФ независимо от того, на имя кого из супругов зарегистрировано право  собственности на квартиру в ЕГРН.

Ваша супруга вправе пользоваться данной квартирой в этом случае. 

Если порядок пользования квартирой не определен или имеется спор между сторонами, он может быть разрешен в судебном порядке.

В судебном же порядке может быть осуществлен раздел общего совместно нажитого имущества.