Игорь!
Полагаю, что позиция заказчика выглядит в данном случае вполне логично и с ним можно согласиться. Если обратиться к положениям ФЗ от 05.04.2013 N 44-ФЗ «О контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг...», то в статье 95 можно увидеть следующие положения:
19. Поставщик (подрядчик, исполнитель) вправе принять решение об одностороннем отказе от исполнения контракта по основаниям, предусмотренным Гражданским кодексом Российской Федерации для одностороннего отказа от исполнения отдельных видов обязательств, если в контракте было предусмотрено право заказчика принять решение об одностороннем отказе от исполнения контракта.
Рискну предположить, что в тексте контракта нет указаний на возможность одностороннего расторжения контракта со стороны исполнителя по указанной причине. Работники исполнителя сами, вне зависимости от позиции работодателя приняли решение прекратить исполнения служебных обязанностей и принять участие в боевых действиях, государство их к этому не обязало и обстановка не делала принятие такого решения неизбежным применительно к деятельности организации-исполнителя, это было решение отдельных работников, они вправе были сделать такой выбор.
В свою очередь, статья 310 Гражданского Кодекса РФ говорит о следующем:
1. Односторонний отказ от исполнения обязательства и одностороннее изменение его условий не допускаются, за исключением случаев, предусмотренных настоящим Кодексом, другими законами или иными правовыми актами.
При этом действующее законодательство, регламентирующее участие граждан в добровольческих формированиях и контрактную службу в ВС РФ, не содержит указаний на то, что такая служба работников, ранее исполнявших служебные обязанности при исполнении контракта, заключённого при исполнении положений указанного Закона №44-ФЗ, является обстоятельством, которое даёт право исполнителю отказаться от дальнейшего исполнения контракта.
Полагаю, что позиция заказчика, который отказывается согласовать расторжение контракта по указанным основаниям, вполне обоснована, а у исполнителя нет объективных причин настаивать на том, что он может прекратить действие контракта в одностороннем порядке без какого-либо ущерба для себя.
Вот хороший анализ по этому поводу garant-victori.ru/priznanie-fors-mazhorom-provedenie-specialnoj-voennoj-operacii