Добрый день.
Есть два варианта.
1. Заключить мировое соглашение.
2. Признать частично иск с условием его оплаты, при условии, отказа истца от исковых требований.
Поскольку, как понимаю дело рассматривается арбитражным судом, то в силу ст. 150 АПК РФ
1. Арбитражный суд прекращает производство по делу, если установит, что:
) истец отказался от иска и отказ принят арбитражным судом;
И в силу ст. 141 АПК РФ
5. По результатам рассмотрения вопроса об утверждении мирового соглашения арбитражный суд выносит определение.
13. Утверждение мирового соглашения в суде первой инстанции влечет за собой прекращение производства по делу полностью или в части.
Составляете Мировое соглашение в 3х экз, предоставляете его на утверждение Арбитражному суду. Арбитражный суд выносит Определение об этом. Далее — стороны добровольно исполняют Мировое соглашение, а при просрочке исполнения, сторона-Кредитор получает Исполнительный лист для принудительного исполнения.
АПК РФ Статья 142. Исполнение мирового соглашения
www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_37800/edf4604cd35ebddd35dce3b4210f706bd5b31ddc/
Уплата долга до вынесения решения суда не спасет Вас от обязанности выплатить судебные расходы, если Истец соблел претензионный порядок урегулирования споров.