Добрый день.
Видится, что нет, отсрочка не предоставляется.
В Указе Президента РФ №664 говорится об отсрочке для студентов, получающих «образование соответствующего уровня впервые»
отсрочка от призыва на военную службу по мобилизации предоставляется студентам, обучающимся по очной и очно-заочной формам обучения по имеющим государственную аккредитацию образовательным программам среднего профессионального и высшего образования в государственных образовательных организациях, в научных организациях и получающим образование соответствующего уровня впервые.
Уровень магистратуры и специалитета приравнены друг к другу согласно ст. 10 Федерального закона от 29.12.2012 № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации»
Уровни профессионального образования в РФ следующие:
1) среднее профессиональное образование;
2) высшее образование — бакалавриат;
3) высшее образование — специалитет, магистратура;
4) высшее образование — подготовка кадров высшей квалификации.
Таким образом выходит, что вы уже получали образование уровня магистратуры, поэтому отсрочка и не полагается.
Формально указ не содержит условия, что при наличии высшего уровня образования нельзя получать более низкий — среднее профессиональное. Поэтому полагаю, что это вполне допустимо.