И прописать все вышесказанные нюансы?

Можно ли это всё документально в каком то договоре или в соглашении оформить? И прописать все вышесказанные нюансы?

 Ночь!

Можете прописать все это в соглашении, но эти условия неисполнимы, если только стороны соглашения не будут его исполнять следуя моральным принципам.

она в этой квартире не будет появляться и не будет иметь никакого отношения к этой квартире.

 Дело в том, что квартира приобретена в браке, поэтому является совместно нажитым имуществом и делится пополам. Долг по ипотеке с момента расторжения брака является общим обязательством сторон.

Используя материнский капитал.

 При всем вышеуказанном, в квартире так же нужно выделить долю всем членам семьи пропорционально вложенного маткапитала.

Исходя из выше изложенного в квартире есть и доля и ребенка и жены и ваша.

Ещё одно условие при исполнении сыну 18 лет (на данный момент три годика) квартира должна перейти сыну.

 В данной ситуации вы можете подарить ребенку только свою долю, а жена свою долю.

Здравствуйте,

не будет иметь никакого отношения к этой квартире

Она не может не иметь к ней никакого отношения, хотя бы в силу того, что в квартиру вложен маткапитал, а значит на основании ст 10 ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей» от 29.12.2006 N 256-ФЗ

4. Лицо, получившее сертификат, его супруг (супруга) обязаны оформить жилое помещение, приобретенное (построенное, реконструированное) с использованием средств (части средств) материнского (семейного) капитала, в общую собственность такого лица, его супруга (супруги), детей (в том числе первого, второго, третьего ребенка и последующих детей) с определением размера долей по соглашению.

Если ещё как по совместно нажитому имуществу Вы могли урегулировать вопрос нотариальным соглашением о разделе имущества кому что достанется после развода, но с использованием маткапитала это невозможно сделать и нотариус это заверять не станет.

Поэтому, как только ипотека за квартиру будет выплачена, в течение 6 месяцев доли в квартире должны быть выделены всем членам семьи, а потом уже делайте что хотите с Вашими долями.