Здравствуйте, Александр.
Вам не положена выплата за найм (поднайм), так как при получении субсидии на приобретение жилья право на ее выплату прекращается.
8. Выплата денежной компенсации прекращается на основании приказа командира воинской части (начальника организации) с первого числа месяца, следующего за месяцем, в котором военнослужащие или члены семей погибших (умерших) военнослужащих утратили основания для получения денежной компенсации, в том числе по причине:
предоставления военнослужащим жилого помещения специализированного жилищного фонда по месту прохождения военной службы или в близлежащем населенном пункте;
предоставления военнослужащим или членам семей погибших (умерших) военнослужащих жилого помещения по договору социального найма или в собственность бесплатно по месту прохождения военной службы;
предоставления военнослужащим или членам семей погибших (умерших) военнослужащих субсидии для приобретения или строительства жилого помещения, в том числе по государственным жилищным сертификатам;
Мое мнение, логика законодателя (МО РФ) в том, что у Вас была возможность приобрести жилье в любом регионе и если Вы его приобрели не по месту службы, то это Ваша проблема.
Как вариант, можете оспорить приказ МО РФ
Но на служебное жилье по месту службы Вы право имеете