Да, представители Сбербанка часто этим грешат: то в реестре не прогрузилось, то заявление с ошибками заполнено, а потом заявление также нужно обработать и зарегистрировать...
Также не совсем понятно, о каком реестре идет речь. Наследственное дело регистрируется в реестре с момента его открытия. Отдельно свидетельство о наследовании движимого имущества не регистрируется.
Здесь может быть два варианта: либо Вам попался неопытный сотрудник, либо в сбербанке есть какая-то внутренняя политика по этим вопросам.
Если при следующем визите Вам снова откажут — зовите руководителя отделения и требуйте чтобы они либо предоставили письменный отказ от выдачи причитающихся Вам средств, либо пусть развернуто объяснят, что по их мнению этому препятствует.