Здравствуйте.
Немного поправлю: в ЕГРЮЛ сведения внесены Налоговой службой (а сама проверка достоверности сведений, скорее всего, осуществлена по причине предоставления сведений от второго учредителя), сам учредитель внести сведения не может. Ниже объясню, почему это важно.
Для начала общие моменты. В соответствии со статьей 11 Федерального закона от 08.08.2001 N 129-ФЗ,
В случае, если по результатам проведения проверки достоверности сведений, включенных в единый государственный реестр юридических лиц, установлена недостоверность содержащихся в нем сведений о юридическом лице, предусмотренных подпунктами «в», «д» и (или) «л» пункта 1 статьи 5 настоящего Федерального закона, регистрирующий орган направляет юридическому лицу, недостоверность сведений о котором установлена, а также его учредителям (участникам) и лицу, имеющему право действовать без доверенности от имени указанного юридического лица (в том числе по адресу электронной почты указанного юридического лица при наличии таких сведений в едином государственном реестре юридических лиц), уведомление о необходимости представления в регистрирующий орган достоверных сведений (далее — уведомление о недостоверности).
В течение тридцати дней с момента направления уведомления о недостоверности юридическое лицо обязано сообщить в регистрирующий орган в порядке, установленном настоящим Федеральным законом, соответствующие сведения или представить документы, свидетельствующие о достоверности сведений, в отношении которых регистрирующим органом направлено уведомление о недостоверности. В случае невыполнения юридическим лицом данной обязанности, а также в случае, если представленные юридическим лицом документы не свидетельствуют о достоверности сведений, в отношении которых регистрирующим органом направлено уведомление о недостоверности, регистрирующий орган вносит в единый государственный реестр юридических лиц запись о недостоверности содержащихся в едином государственном реестре юридических лиц сведений о юридическом лице.
Особого значения, направлялись ли Вам сведения о проводимой проверке, сейчас, если сведения уже внесены в ЕГРЮЛ, (Вы, полагаю, проверили наличие пометки о недостоверности сведений в выписке ЕГРЮЛ? Если нет, проверьте здесь egrul.nalog.ru/, введя свой ИНН или ОГРН и скачав выписку). То есть ненаправление сведений о проверке является основанием для отмены результатов проверки, но здесь самый важный момент состоит в том, действительно ли сами сведения недостоверны. Если они достоверны — нужно обжаловать сами результаты проверки в суд. Если недостоверны — просто изменить те обстоятельства, с которыми связана недостоверность (в Вашем случае нужно сменить руководителя — Президента) и предоставить Налоговой службе документы, подтверждающие это, то есть приказ о назначении, протокол собрания с решением о назначении, копию Устава, документ, удостоверяющий личность и пр.
Какие последствия этой записи?
В соответствии со статьей 21.1. № 129-ФЗ
Юридическое лицо, которое в течение последних двенадцати месяцев, предшествующих моменту принятия регистрирующим органом соответствующего решения, не представляло документы отчетности, предусмотренные законодательством Российской Федерации о налогах и сборах, и не осуществляло операций хотя бы по одному банковскому счету, признается фактически прекратившим свою деятельность (далее — недействующее юридическое лицо). Такое юридическое лицо может быть исключено из единого государственного реестра юридических лиц в порядке, предусмотренном настоящим Федеральным законом.
…
5. Предусмотренный настоящей статьей порядок исключения юридического лица из единого государственного реестра юридических лиц применяется также в случаях:
а) невозможности ликвидации юридического лица ввиду отсутствия средств на расходы, необходимые для его ликвидации, и невозможности возложить эти расходы на его учредителей (участников);
б) наличия в едином государственном реестре юридических лиц сведений, в отношении которых внесена запись об их недостоверности, в течение более чем шести месяцев с момента внесения такой записи.
То есть теоретически возможно исключение из ЕГРЮЛ. Но на практике такое происходит редко, если сотрудники организации идут на контакт с Налоговой и готовы предоставлять необходимые документы.
Какие действия нужно предпринять?
Это зависит от самого главного, как указал выше, от того, действительно ли сведения недостоверны. Если да и руководитель фиктивный — нужно его менять. Если нет — обжаловать действия Налоговой в суд и предоставлять доказательства достоверности сведений.
Кроме этого при наличии записи в ЕГРЮЛ о недостоверности сведений, в отношении учредителей, владеющих не менее 50 % голосов, применяется 3 -летнее ограничения на последующее участие в регистрациях юридического лица.
Ваш клиент, как единоличный исполнительный орган ООО вправе направить мотивированное заявление о несогласии с записью о недостоверности сведений либо направить заявление о внесении изменений в ЕГРЮЛ, в части изменения недостоверных сведений.