Куда обращаться, если в налоговой инспекции отражены суммы доходов(зп и дополнительные выплаты, вознаграждения)в два раза превышающие фактические выплаты работнику?

Здравствуйте, Алексей.

Если Вы можете доказать, что Вам начисляли заработную плату в большем размере, чем выплачивали на руки (с учетом всех законных удержаний, конечно), то Вы вправе обратиться в суд для взыскания с работодателя невыплаченной части заработной платы.

Однако, если Вы расписывались за бОльшую сумму, чем получали, то доказать недоплату Вы не сможете. 

Для начала затребуйте в порядке ст. 62 ТК РФ у работодателя расчетные листки за спорный период и справку по НДФЛ, получите в ПФР выписку по лицевому счету (лично или через Госуслуги, есть есть идентифицированный профиль) и сравните все суммы. Потом уже решайте, что делать.