Там работодатель сделал отметку об отмене записи по статье и внес запись увольнения по инициативе работника

Внесение записей в трудовую книжку, также как и решение вопросов о неверных записях в трудовых книжках, о процедуре аннулирования записей в трудовых книжках регламентировано Разделом 3 Правил ведения и хранения трудовых книжек, изготовления бланков трудовой книжки и обеспечения ими работодателей, утв. Постановлением Правительства РФ от 16.04.2003 г. № 225, и Разделм 1 Инструкции по заполнению трудовых книжек, утв. Постановлением Минтруда РФ от 10.10.2003 г. № 69.

п. 1.2 Инструкции предусматривает в случае необходимости внесения исправлений в запись о приеме на работу (увольнении) за неточной (неверной) записью проставлять следующий номер, текущую дату, в третьей графе записи указать: «Запись за № … недействительна». Далее производится правильная запись. В четвертой графе записи в качестве основания ее внесения указывается приказ работодателя, изданный на основании решения суда, а не само решение суда о признании, например, увольнения незаконным и аннулировании соответствующей записи о таком увольнении в трудовой книжке. 

Т.е. произвольно исключить аннулированную запись в трудовой книжке нельзя.

Согласно ст. 66.1 ТК РФ, введенной в действие с 01.01.2020 г. на основании  ФЗ от 16.12.2019 г. № 439-ФЗ «О внесении изменений в ТК РФ в части формирования сведений о трудовой деятельности в электронном виде» 

работодатель формирует в электронном виде основную информацию о трудовой деятельности и трудовом стаже каждого работника и представляет ее в порядке, установленном законодательством РФ об индивидуальном (персонифицированном) учете в системе обязательного пенсионного страхования, для хранения в информационных ресурсах Пенсионного фонда РФ.
В сведения о трудовой деятельности включаются информация о работнике, месте его работы, его трудовой функции, переводах работника на другую постоянную работу, об увольнении работника с указанием основания и причины прекращения трудового договора, другая предусмотренная настоящим Кодексом, иным федеральным законом информация.

Т.е. в электронном виде также дублируется информация о трудовой деятельности работника. 

Несоблюдение правил исправления неверных записей в трудовых книжках является нарушение законодательства о труде с возможным привлечением работодателя или виновного должностного лица (кадровика) к ответственности по ст. 5.27 КоАП РФ.