Подскажите пожалуйста, я хочу открыть компанию, которая будет покупать ценные бумаги для себя и при

Добрый день, Сергей.

Вопрос — какую систему налогообложения выбрать для такой компании 

Вам подойдет упрощенная система налогообложения с объектом обложения «доходы, уменьшенные на величину расходов» (ст.346.14 Налогового кодекса РФ). По общему правилу, полученная разница между выручкой от продажи акций и расходами на их покупку облагается по ставке 15%.

Это подтверждается письмом Минфина РФ № 03-11-06/2/47963 от 11.11.2013

Таким образом, налогоплательщики, применяющие упрощенную систему налогообложения с объектом налогообложения в виде доходов, уменьшенных на величину расходов, при определении налоговой базы вправе учитывать затраты на приобретение ценных бумаг (в случае приобретения их для дальнейшей реализации)

какой ОКВЭД лучше всего подходит?

64.99.2  — Деятельность дилерская

Эта группировка включает:

-проведение операций с ценными бумагами, осуществляемые за собственный счет

64.99.1 - Вложения в ценные бумаги

Эта группировка включает:
— капиталовложения в акции, облигации, векселя, ценные бумаги акционерных фондов и паевых инвестиционных фондов и т.п.

Денежные средства для покупки планируется переводить с другого юр лица. Пока предполагаю что это будет типа договора займа (если есть ещё какие то способы, расскажите пожалуйста).

Да, оптимальный вариант для Вашей компании — это заём, так как его получение и возврат не облагаются налогами. Иных безналоговых способов не предусмотрено.

С уважением, Роман.