Здравствуйте, Ольга! Вопрос, бесспорно, неоднозначный, но существует единый Федеральный реестр сведений о документах об образовании в ведении Рособрнадзора. Любой желающий (в том числе сотрудники приемной комиссии вуза) может ознакомиться:
http://obrnadzor.gov.ru/ru/act...
Ответить точно, узнают о вашей первой ординатуре или нет, не представляется возможным, поскольку всё будет зависеть от приемной комиссии в целом, сотрудников вуза в частности, насколько тщательно они подходят к персоне абитуриентов во время поступления. Скорее всего возникнут определенные вопросы, что вы поступаете не сразу после получения первого этапа медицинского образования, а через определенной промежуток времени (например, 2 года). В теории, ваши действия в самом худшем варианте могут расценить как мошенничество, что уголовно-наказауемо.