На сколько я знаю, за три прошедших года уже не имеют права с меня взыскивать эти налоги

Если это вынесен судебный приказ пишите заявление на его отмену.

Статья 128 ГПК  РФ. Извещение должника о вынесении судебного приказа

Судья в пятидневный срок со дня вынесения судебного приказа высылает копию судебного приказа должнику, который в течение десяти дней со дня получения приказа имеет право представить возражения относительно его исполнения.

Статья 129. Отмена судебного приказа

При поступлении в установленный срок возражений должника относительно исполнения судебного приказа судья отменяет судебный приказ. В определении об отмене судебного приказа судья разъясняет взыскателю, что заявленное требование им может быть предъявлено в порядке искового производства. Копии определения суда об отмене судебного приказа направляются сторонам не позднее трех дней после дня его вынесения.

   Дмитрий, здравствуйте. 

     Вам следует, прежде всего, подать  юридически обоснованную апелляционную жалобу на судебное решение, принятое судом без вашего участия в процессе.  Жалоба подается на основании и в соответствии со ст. 320 и др. ГПК РФ. В ходе апелляционного рассмотрения можно будет выяснить, почему без извещения, как и на каком основании было принято такое решение.

     Согласно закона срок для подачи в суд заявления составляет три года. Налоговая инспекция имела право подать в суд иск о взыскании транспортного налога за 2016 г. до 1 декабря 2017 г. Скорее всего, инспекция такой трехлетний срок не пропустила. Но все это можно выяснить в  процессе при рассмотрении апелляционной жалобы.

     С наилучшими пожеланиями, Воробьев Н.И., к.ю.н.