Здравствуйте, Ирина!
С учётом того, что Вы проживаете с детьми в служебной квартире (как я понимаю, Вы и дети признаны нуждающейся в служебном жилье от своей воинской части), а Ваш муж отдельно, то по своему месту службы, Ваш муж может быть признан нуждающимся в жилье только один, поскольку с точки зрения законодательства Вы уже обеспечены жильём.
Так, например, Приказом Министра обороны РФ от 30 сентября 2010 г. N 128 «О предоставлении военнослужащим Вооруженных Сил Российской Федерации жилых помещений по договору социального найма и служебных жилых помещений», определено, что военнослужащий для признания нуждающимся в жилых помещениях предоставляет среди документов
а) копии документов, удостоверяющие личность военнослужащих и совместно проживающих с ними членов их семей — граждан Российской Федерации (далее именуются — члены их семей) (паспортов с данными о регистрации по месту жительства, свидетельств о рождении лиц, не имеющих паспортов);
и) сведения о наличии (отсутствии) жилых помещений, занимаемых по договорам социального найма и (или) принадлежащих на праве собственности военнослужащему и членам его семьи, по рекомендуемому образцу согласно приложению N 2 к настоящей Инструкции.
Поэтому одного мужа должны признать, но только его, пока Вы не проживаете вместе.
Другой вопрос в том, почему Вы не служите в мужем в одной части, либо хотя бы в одном гарнизоне. По смыслу положений Указа Президента РФ от 16 сентября 1999 г. N 1237 «Вопросы прохождения военной службы», супруги-военнослужащие должны проживать, а равно служить в одном населенном пункте (гарнизоне).
ч. 2 ст. 54 Семейного кодекса РФ установлено, что каждый ребенок имеет право жить и воспитываться в семье, насколько это возможно, право знать своих родителей, право на их заботу, право на совместное с ними проживание, за исключением случаев, когда это противоречит его интересам.
Такие же базовые принципы закреплены в Конвенции ООН о правах ребенка (одобрена Генеральной Ассамблеей ООН 20.11.1989), ратифицированная в РФ.
Поэтому если такое желание есть, то кто-то из Вас (Вы или муж) пишите мотивированный рапорт о переводе, в связи с невозможностью совместного проживания. После перевода будете проживать совместно и признаетесь нуждающимися в жилье.
Раздельноживцт именно в связи с переводом?