Когда пишется кассационная жалоба, если подали надзорную жалобу в ВС РФ?

Скроее всего вам ее просто вернут, поскольку подача кассации по тем же правовым основаниям  недопустима. Вместе с тем, из п.8 Пленума «О применении норм главы 47.1 УПК РФ»  следует, что если из повторных кассационных жалобы, представления, поданных в порядке выборочной кассации, усматриваются основания для отмены или изменения обжалуемого решения, такие жалоба, представление подлежат рассмотрению в установленном законом порядке. Возможно у вас появились и другие доводы. Экспертизу в Пирогова по факту экспертизой не назовешь, поскольку она проводиться по назначению органов следствия и суда, защитник такими полномочиями не обладает, к сожалению. Кроме этого приговор у вас вступил в силу. Тем не менее, попытайтесь. Если заключение специалистов грамотное и развернутое, возможно это сыграет решающую роль. Кассационный суд если это Москва, второй на Верейской, однако жалоба будет рассматриваться в порядке выборочной кассации, т.е., единолично судьей.