Элина, добрый день!
В Вашем случае Вы, конечно, можете себе выплатить зарплату, но когда объявится второй учредитель, он может оспорить «заключенный» договор. К тому же Вам ФНС, ФСС, ПФР начислят штрафы, поскольку Вы своевременно не оплатили взносы и т.п.
То есть Вы должны понимать, что помимо ЗП Вы получите еще штрафы.
Если второй учредитель не выходит на связь, то рекомендую Вам исключить его из состава участников. В результате Вы будете единственным участником и директором, и будете самостоятельно владеть компанией.
Если Вы оставите все как есть, то спустя время второй участник может объявиться и потребовать часть дивидендов от деятельности компании (даже если он и не принимал никакого участия в ее деятельности), и Вы будете обязаны выплатить ему доходы!
С уважением,
Генеральный директор Общества с ограниченной ответственностью «Лобанов Груп Компани»
А.М. Лобанов